热带病与寄生虫学

热带病与寄生虫学 ›› 2019, Vol. 17 ›› Issue (4): 210-213.

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日本血吸虫虫卵分泌物小 RNA的高通量测序

徐桂娜 何雪梅 周晓蓉 曾凡胜 秦志强   

  1. ４１３００２ 湖南省益阳市，益阳市洞庭湖区血吸虫与病原生物控制技术重点实验室、益阳医学高等专科学校（徐桂娜、何雪梅、曾凡胜），湖北省疾病预防控制中心（ 周晓蓉），中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所、世界卫生组织热带病合作中心（秦志强）
  • 出版日期:2019-12-10 发布日期:2020-01-21
  • 基金资助:

    上海市自然科学基金（１７ＺＲ１４３３３００）；益阳市科技局 创 新 平 台 与 人 才 计 划 （２０１８ 年）； 益 阳 市 社 科 基 金（２０１６ＹＳ５７）

  • Online:2019-12-10 Published:2020-01-21

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摘要： 目的 通过对日本血吸虫虫卵分泌物（ ｅｇｇ ｓｅｃｒｅｔｅｄ ｐｒｏｄｕｃｔｓ，ＥＳＰ） 的小 ＲＮＡ 进行高通量测序， 分析、鉴定已知 ｍｉＲＮＡ 的表达水平。 方法 提取日本血吸虫虫卵 ＥＳＰ ｍｉＲＮＡ 进行高通量测序；通过对数据 分析包括统计长度分布与比对注释，鉴定已知 ｍｉＲＮＡ 的表达水平。 结果 将构建文库中日本血吸虫虫卵 ＥＳＰ 表达的 ｍｉＲＮＡ 与最新 ｍｉＲＢａｓｅ 数据库中的 ｍｉＲＮＡ 比对，发现在鉴定的 １２ 个 ｍｉＲＮＡｓ 中，ｓｊａ － ｍｉＲ － ３４８８ 为表达量最高的 ｍｉＲＮＡ，其次为 ｓｊａ － ｍｉＲ － ３６ － ３ｐ 和 ｓｊａ － ｍｉＲ － ７１ａ，上述三种 ｍｉＲＮＡ 表达量占比 ９１ ８％ 。 结论 日本血吸虫虫卵 ＥＳＰ 三个 ｍｉＲＮＡｓ（ ｓｊａ － ｍｉＲ － ３４８８、ｓｊａ － ｍｉＲ － ３６ － ３ｐ 和 ｓｊａ － ｍｉＲ － ７１ａ） 的鉴定为下一步探寻血吸虫病诊疗新靶标奠定了基础。

关键词: miRNA, 高通量测序, 日本血吸虫, 虫卵分泌物