热带病与寄生虫学 ›› 2024, Vol. 22 ›› Issue (4): 233-238.doi: 10.20199/j.issn.1672-2302.2024.04.009
葛盈露1(), 杨灵康1, 刘以诺2, 马婉婉1, 王鹏1, 孙永1, 史永林1,2(
)
收稿日期:
2024-03-07
出版日期:
2024-08-20
发布日期:
2024-08-30
通信作者:
史永林,E-mail: 作者简介:
葛盈露,女,硕士,主管技师,研究方向:病原微生物检验。E-mail: 基金资助:
GE Yinglu1(), YANG Lingkang1, LIU Yinuo2, MA Wanwan1, WANG Peng1, SUN Yong1, SHI Yonglin1,2(
)
Received:
2024-03-07
Online:
2024-08-20
Published:
2024-08-30
Contact:
SHI Yonglin, E-mail: 摘要:
目的 了解安徽省手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)发病情况、柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16, CV-A16)基因型别分布情况和VP1基因进化特征。方法 通过中国疾病预防控制信息系统对2021—2023年安徽省HFMD发病情况和病原学检测情况进行统计。收集HFMD患者咽拭子样本,分离得到CV-A16 毒株,对其VP1区进行PCR扩增和基因序列测定,使用肠道病毒在线分型工具鉴定基因亚型,运用MegAlign比较核苷酸和氨基酸同源性,利用MEGA 6.0构建进化树,并分析 VP1 区氨基酸变异位点。结果 2021—2023年安徽省累计报告HFMD病例155 640例,年均报告发病率为84.83/10万。2021—2023年安徽省16个地市共报告HFMD实验室确诊病例12 643例,其中CV-A16占18.16%(2 296/12 643),各年度构成比分别为25.81%(1 127/4 366)、33.69%(782/2 321)和6.50%(387/5 956)。2021—2023年安徽省共分离到HFMD CV-A16 毒株72株,其中B1a和B1b 基因亚型分别为58株(占80.56%)、14株(占19.44%)。两种亚型毒株与CV-A16原型株G-10的核苷酸和氨基酸同源性分别为73.80%~76.20%和90.60%~92.30%。进化树显示B1a基因亚型流行株在遗传进化上分为 4个分支簇,B1b基因亚型流行株形成3个分支簇。72条VP1区基因序列与原型株比较发现了26个氨基酸位点发生变异。结论 2021—2023年安徽省HFMD CV-A16主要流行的基因亚型为B1a和B1b,B1a为优势基因亚型,应加强对CV-A16流行毒株的分子监测。
中图分类号:
葛盈露, 杨灵康, 刘以诺, 马婉婉, 王鹏, 孙永, 史永林. 2021—2023年安徽省手足口病柯萨奇病毒A组16型分子分型研究[J]. 热带病与寄生虫学, 2024, 22(4): 233-238.
GE Yinglu, YANG Lingkang, LIU Yinuo, MA Wanwan, WANG Peng, SUN Yong, SHI Yonglin. Molecular characterization of coxsackievirus A16 associated hand, foot and mouth disease in Anhui Province from 2021 to 2023[J]. Journal of Tropical Diseases and Parasitology, 2024, 22(4): 233-238.
表2
2021—2023年安徽省 CV-A16 VP1区氨基酸位点变异情况
基因型/亚型 | 3 | 11 | 13 | 14 | 15 | 17 | 19 | 22 | 23 | 26 | 33 | 36 | 43 | 59 | 61 | 79 | 119 | 139 | 164 | 179 | 183 | 213 | 215 | 217 | 220 | 251 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
A/G-10 | G | A | T | S | R | G | A | S | L | E | N | E | L | Q | E | T | M | A | T | I | L | A | P | S | A | V |
2021-B1a(n=18) | P | T | N | N | Q | N | S | A/T | L | L | E | S | V | S | K | A | L | V | K | V | M | E | L | A/V | L | I |
2022-B1a(n=28) | P | T | N | N | Q | N | S | A/T | L | L | E | S | V | S | K/R | A | L | V | K | V | M | E | L | A | L | I |
2023-B1a(n=12) | P | T | N | N | Q | N | S | A/T | L | L | E | S | V | S | K/R | A | L | V | K | V | M | E | L | A | L | I |
2021-B1b(n=6) | P | T | N | S | Q | N | S | A | M | L | E | S | V | S | K | A | L | V | T | V | M | E | L | A | L | V |
2022-B1b(n=8) | P | T | N | S | Q | N | S | A | M | L | E | S | V/I | S | K | A | L | V | T | V | M | E | L | A | L | V |
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