微卫星和线粒体生物技术在湖北钉螺遗传分化研究中的应用

doi:10.20199/j.issn.1672-2302.2024.06.011

热带病与寄生虫学 ›› 2024, Vol. 22 ›› Issue (6): 375-381.doi: 10.20199/j.issn.1672-2302.2024.06.011

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微卫星和线粒体生物技术在湖北钉螺遗传分化研究中的应用

李春英¹(), 崔晓², 杜春红³^,⁴, 王洪琼³^,⁴, 杨早改¹, 王云松³^,⁴, 宋静³^,⁴(), 董毅³^,⁴()

1 昆明医科大学公共卫生学院，云南昆明 650000
2 大理大学公共卫生学院
3 云南省地方病防治所，云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室
4 云南省公共卫生与生物安全重点实验室

收稿日期:2024-04-01 出版日期:2024-12-20 发布日期:2025-01-23
通信作者: 宋静,448022929@qq.com;董毅,dydali@sina.com
作者简介:李春英，女，硕士在读，研究方向：血吸虫病防治。E-mail: 994563616@qq.com
基金资助:
云南省地方病防治所青年科技人才培养项目(YIEDC-G202101);大理州科技局科技研发基础研究计划项目(D2022ZA0115);大理州科技计划项目(20242901A020013);云南省公共卫生与生物安全重点实验室开放课题(KLPHB-2023-04)

Genetic differentiation of Oncomelania hupehensis by microsatellite and mitochondrial molecular biotechnology

LI Chunying¹(), CUI Xiao², DU Chunhong³^,⁴, WANG Hongqiong³^,⁴, YANG Zaogai¹, Wang Yunsong³^,⁴, SONG Jing³^,⁴(), DONG Yi³^,⁴()

1 School of Public Health, Kunming Medical University, Kunming 650000, Yunnan Province, China
2 School of Public Health, Dali University
3 Yunnan Institute of Endemic Diseases Control and Prevention, Yunnan Key Laboratory of Natural Epidemic Diseases Prevention and Control Technology
4 Yunnan Provincial Key Laboratory of Public Health and Biosafety

Received:2024-04-01 Online:2024-12-20 Published:2025-01-23
Contact: SONG Jing,448022929@qq.com;DONG Yi,dydali@sina.com

摘要/Abstract

摘要：

湖北钉螺作为日本血吸虫的唯一中间宿主，其地理分布对于血吸虫病的流行和扩散具有重要作用，开展钉螺遗传多样性研究对于钉螺控制乃至血吸虫病防治工作具有重要意义。随着分子生物学技术的快速发展，各种分子标记及测序技术在湖北钉螺遗传分化研究中得到广泛运用，尤其是微卫星DNA分子标记和线粒体DNA序列测定技术在湖北钉螺种群遗传分化研究中具有明显优势。本文对应用微卫星DNA分子标记技术和线粒体DNA序列测定技术开展的湖北钉螺遗传分化相关研究进行综述。

关键词: 湖北钉螺, 遗传分化, 微卫星DNA, 线粒体DNA

Abstract:

Oncomelania hupensis is the sole intermediate host of Schistosoma japonicum. Its geographical distribution plays crucial roles in the transmission and prevalence of schistosomiasis. Therefore, investigation on the snail genetic differentiation is greatly significant for snail and schistosomiasis control. With rapid development of molecular biology, a variety of molecular markers and sequence determination techniques have been widely used in the study of genetic differentiation of O. hupensis, among which DNA molecular markers and mitochondrial DNA sequence determination techniques possess obvious superiority in the study of genetic differentiation of O. hupensis population. This paper reviews the genetic differentiation of O. hupensis by using microsatellite DNA markers and mitochondrial DNA sequencing techniques.

Key words: Oncomelania hupensis, Genetic differentiation, Microsatellite DNA, Mitochondria DNA

中图分类号:

R184.38

李春英, 崔晓, 杜春红, 王洪琼, 杨早改, 王云松, 宋静, 董毅. 微卫星和线粒体生物技术在湖北钉螺遗传分化研究中的应用[J]. 热带病与寄生虫学, 2024, 22(6): 375-381.

LI Chunying, CUI Xiao, DU Chunhong, WANG Hongqiong, YANG Zaogai, Wang Yunsong, SONG Jing, DONG Yi. Genetic differentiation of Oncomelania hupehensis by microsatellite and mitochondrial molecular biotechnology[J]. Journal of Tropical Diseases and Parasitology, 2024, 22(6): 375-381.

图/表 1

表1

微卫星位点及其引物序列的基本信息

位点	引物序列（5′→3′）	重复单元	位点大小（bp ）	等位基因大小（bp ）	文献出处
（CA）₈RY	CACACACACACA —CACARY				[11-12]
P84	F : GTTGCAGATTCCGAAAGA	(TACAT)₃	140	130-160	[4,14]
P84	R: GATCAGGGGTTGTCCAGT	(TACAT)₃	140	130-160	[4,14]
T5-13	F: TAGTGGGACTTATTTGCTG	(GT)₁₄…(GT)₆	245	193-99	[4,13-14]
T5-13	R: AAGGCTGAGTGGTAGTTA	(GT)₁₄…(GT)₆	245	193-99	[4,13-14]
T5-11	F: ACGCCAGTCTTGGTGTCA	(GT)₁₄	173	157-207	[4,13-14]
T5-11	R: TACTTGGGCAGAAGGGTT	(GT)₁₄	173	157-207	[4,13-14]
T4-22	F: TATCCAAGAAGCCGAAAC	（CA)₁₀	244	232-276	[4,13-14]
T4-22	R: GAGGAAAGCGAGGTAAGA	（CA)₁₀	244	232-276	[4,13-14]
T6-27	F: AATGACACCCCGAACAAA	(G)₁₃…(GT)₆ GG(GT)₁₂	204	164-212	[4,13-14]
T6-27	R: CACTTCTCAACTCCAACCT	(G)₁₃…(GT)₆ GG(GT)₁₂	204	164-212	[4,13-14]
P82	F : AAGAACTGCTCATACTGGAAAG	(GGA)₄(GAA)₁₂ (TCCTA)₂	179	170-239	[4,13-14]
P82	R: GTGGTGCCCCTACGACCT	(GGA)₄(GAA)₁₂ (TCCTA)₂	179	170-239	[4,13-14]
T6-47	F: CCGAAGTGATAGAAACCG	(GT)₆(GT)₉	190		[13]
T6-47	R: AGGCAGAAATGGGCAGAC	(GT)₆(GT)₉	190		[13]
T5-21	F: ATAAGTTTAGCCAGTCACC	(GT)₁₆(GT)₇	199		[13]
T5-21	R: ACACGCAGTCCACGCACA	(GT)₁₆(GT)₇	199		[13]
T4-36	F: CGGGTTACGGGAAAGGAT	(CA)₁₇	252		[13]
T4-36	R: AGGGACGAACTCACGAAG	(CA)₁₇	252		[13]
E3	F: CCAAACCCTCTTCAACAC	(CA)₁₅	190		[13]
E3	R: GCCGAAAGAAATTCTACG	(CA)₁₅	190		[13]
E15	F: AAAGAACCGAATCAGGAC	(CA)₂₁(CA)₁₄ (CA)₈	189		[13]
E15	R: TACCAGCCGATGAATAAA	(CA)₂₁(CA)₁₄ (CA)₈	189		[13]
D17	F: CATCGTTGACACGGGTTT	(GT)₃₂	232		[13]
D17	R: TGGGCTGTTGGTCCTCTT	(GT)₃₂	232		[13]
C23	F: CTGGACCTAAAGCAATAAC	(GT)₁₄	172		[13]
C23	R: GAGCCAATCACCTAAACTA	(GT)₁₄	172		[13]
B14	R: AGAAAGCAGCATGACCCA	(CT)₉	337		[13]
B14	F: AGGTGGCATTATCGAATT	(CT)₉	337		[13]
T6-17	F：GGCCTGCCTTGGTTTTTTCACGTAG	(AC)₈	244		[15-16]
T6-17	R: AGCTTGGGATCATCTCCAGGTC	(AC)₈	244		[15-16]
P101	F: AGGTCACGCTTTCTGCATTT	(TG)₁₃(TTG)₈	181		[15-16]
P101	R: GTGCAACCATGTGTTGTGGT	(TG)₁₃(TTG)₈	181		[15-16]
D11	F: AGCTTGGGATCAGAATGTCGTTTGT	(TG)₁₇	218		[15-16]
D11	R: TATGTAGATGTTCACTGGTTTGTCC	(TG)₁₇	218		[15-16]
B14	F: CAGTCACAGCGCAGCCTACGA	(AG)₃₃	207		[15-16]
B14	R: TCAAGCGACCTGATGTCAAATACC	(AG)₃₃	207		[15-16]
T4-33	F: GTCAAAACAACGAGGGCTGT	(AC)₁₉	171		[15-16]
T4-33	R: CTGAGTGGAATGGGAGTTGG	(AC)₁₉	171		[15-16]
C22	F: TGGGATCGGTACATCTGGATAGTGG	(CA)21	235		[15-16]
C22	R: GGGATCAATGAAAGTTCTTGCGTTC	(CA)21	235		[15-16]
A18	F: GCCGATGATACAAGACCC	(CT)18	139		[17-18]
A18	Rf: GAGAATCTCCAGGCACGC	(CT)18	139		[17-18]
C22	F: CGGTACATCTGGATAGTGG	(CA)21	189		[17-18,20???-24]
C22	Rf: TGCGAAACAGTTGCAGACAC	(CA)21	189		[17-18,20???-24]
T4-33	F: ACGTCAAAACAACGAGGGC	(AC)19	175		[17-18]
T4-33	R: TACTGAGTGGAATGGGAG	(AC)19	175		[17-18]
T6-17	F: GCTGTCCTTTTACCAACTGC	(AC)8	192		[17-18]
T6-17	R: TATCAAAGGATTATGCCGAG	(AC)8	192		[17-18]
D11	F: TTCAGTTGTCTTATTTCGTG	(TG)17	167		[17]
D11	R: TAGATGTTCACTGGTTTGTC	(TG)17	167		[17]
B14	F: GAAGGCGGCAGCAGCAAC	(AG)33	149		[17]
B14	R: AGCGACCTGATGTCAAATAC	(AG)33	149		[17]
T4-43	F: TCGGTTACTAGCAAGACG	(GA)33	242		[17]
T4-43	R: TCGAATGGATAGGAGCAT	(GA)33	242		[17]
E3	F: GATTTGTGAAAGTGAGGGTA	(CA)33	255		[17]
E3	R: TAGCAGGCGTCAAGGTAA	(CA)33	255		[17]
T1-10	F: TCACTCGGGTGTAATGCT	(GA)38	228		[17]
T1-10	R: TTTGTTACTGATGGTGGC	(GA)38	228		[17]
T4-25	F: CAATAGTTCGACTCGGAAGA	(CT)35	180		[17]
T4-25	R: CGAGGTATGGCGTTGCTI	(CT)35	180		[17]
B14	F: GGCAGTTTTGATTAGCTTGGT	(AG)₃₃	172		[20???-24]
B14	R: ACCTGATGTCAAATACCAGTTAG	(AG)₃₃	172		[20???-24]
T6-17	F: GCTGTCCTTTTACCAACTGC	(AC)₈	192		[20???-24]
T6-17	R: TATCAAAGGATTATGCCGAG	(AC)₈	192		[20???-24]
DH02	F: AGGCGATTTATGCAGTTCCC	(AGA)₁₂	218		[20???-24]
DH02	R: TGCGAAACAGTTGCAGACAC	(AGA)₁₂	218		[20???-24]
DH01	F: GATCAATACCAGCAACTACT	(TCA)₃₃	462		[20???-24]
DH01	R: ATGATGCAGACTTGTAACGC	(TCA)₃₃	462		[20???-24]
E3	F: CTTGTGACGATGACGACCCT	(CA)₃₃	302		[21-22]
E3	R: GCGGGTTATGAGCTGCGATTAC	(CA)₃₃	302		[21-22]
C23	F: GTCCGGTCCTGATTTGGCTA	(GT)₁₄	339		[21-22]
C23	R: GGAATGGAGCGAGGTTCTTAC	(GT)₁₄	339		[21-22]
D17	F: TTTAGTCCCCTTTGGCGTGTG	(GT)₃₂	238		[21-22]
D17	R: GCTTGGCCTCGTTACCCAATAT	(GT)₃₂	238		[21-22]
T4-36	F: CGGGTTACGGGAAAGGAT	(CA)₁₇	248		[21-22]
T4-36	R: AGGGACGAACTCACGAAG	(CA)₁₇	248		[21-22]
T4-33	F: GTCAAAACAACGAGGGCTGT	(AC)19	171		[21-22]
T4-33	R: CTGAGTGGAATGGGAGTTGG	(AC)19	171		[21-22]
T1-10	F: TCACTCGGGTGTAATGCT	(GA)₃₈		173-259	[20,23-24]
T1-10	R: TTTGTTACTGATGGTGGC	(GA)₃₈		173-259	[20,23-24]
T4-25	F: CAATAGTTCGACTCGGAAGA	(CT)₃₅		142-228	[20,23-24]
T4-25	R: CGAGGTATGGCGTTGCTI	(CT)₃₅		142-228	[20,23-24]
T4-22	F: TATCCAAGAAGCCGAAAC	（CA)₁₀		224-256	[20,23-24]
T4-22	R: GAGGAAAGCGAGGTAAGA	（CA)₁₀		224-256	[20,23-24]
D11	F: CAGAATGTCGTTTGTGGTGGT	(TG)₁₇	206		[21-22,24]
D11	R: TGTAGATGTTCACTGGTTTGTC	(TG)₁₇	206		[21-22,24]

表1

参考文献 49

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微卫星和线粒体生物技术在湖北钉螺遗传分化研究中的应用

Genetic differentiation of Oncomelania hupehensis by microsatellite and mitochondrial molecular biotechnology

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[1]	马晓荷, 汪敏, 朱磊, 郭见多, 李清越, 刘婷, 翟杜娟, 孙成松, 张世清, 汪天平. 安徽省不同地区日本血吸虫群体线粒体基因遗传变异研究[J]. 热带病与寄生虫学, 2021, 19(5): 254-.
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